目前二甲、三甲医院在普通胃镜检查方面水平几乎一样。但是在医生水平、检测费用、预约时间等方面还存在一定的区别。

一、医生水平：

通常情况下三甲医院的医生水平相对较高，在各种特殊的胃镜检查，比如放大胃镜、色素胃镜等方面更有优势，在胃镜特殊治疗方面(例如，大出血、取异物、及各种胃镜下的手术方面)，三甲医院开展的更全面，技术更成熟。

二、检测费用：

一般的二甲医院进行胃镜检查的费用为200-300元左右。如果在三甲医院做胃镜的费用可能要稍微高一些，无痛性胃镜检查一般需要1000元左右，普通的胃镜检查大概费用在300元左右。但是由于地区不同，收费的标准取决于城市的消费水平和当地医院的收费标准。

三、预约时间：

一般情况下做胃镜检查是需要提前预约的。对于不同级别的医院，不同地区的胃镜检查情况，预约时间是不等的。二甲医院预约胃镜比较方便，预约时间较短，通常在当天就能进行检查；三甲医院的预约时间则相对较长，如果是为了进行特殊胃镜检查或进行镜下治疗可以选择三甲医院进行预约。